对烤烟主要病害的调查结果显示，施用生物有机肥能在一定程度上降低烤烟的花叶病、气候斑、野火病、赤星病和青枯病的发病率，降低花叶病和气候斑的病情指数。这可能是肥料中的菌群可以激活土壤中的有益成分，提高土壤中有益菌群的数量，改良土壤本身的营养状况，从而增强烤烟抗性, 减轻病害。

施用生物有机肥烤烟的化学成分均处于协调和基本合理范围之内，对改善烤烟香吃味有一定效果。综上所述，生物有机肥在促进烤烟生长发育、降低烤烟病害、提高烤烟产量品质等方面均有较好的效果，可在各大烟区推广应用。