生物有机肥料具有很好的培肥效果，可以改良土壤，协调土壤中空气与水分的比例，增加土壤生物活性，提高土壤质量。蔬菜土壤生态环境退化严重。随栽培年限的延长，土壤出现了板结、酸化、盐渍化和连作障碍等一系列问题。生物有机肥在修复设施蔬菜土壤障碍方面提供了一种新的途径，长期施用生物有机肥可以提高土壤肥力，改善土壤理化性质，调控土壤微生物群落结构，加速退化土壤生态系统的恢复进而施用生物有机肥可以促进蔬菜生长和发育，提高其产量和品质。

重金属元素在土壤—蔬菜体系中的累积和迁移行为较为复杂，不仅受到蔬菜品种和土壤生物化学性质的影响，还与重金属元素本身的特性及其在土壤中的状态有关。在通常情况下，土壤中的重金属含量保持在一定浓度范围内，并不表现出对环境或者作物的明显影响，但是当土壤中重金属含量超过其承载能力时，就会表现出一系列的危害，包括在作物中累积、抑制土壤微生物活性、污染地下水等。