育苗是西瓜栽培的重要环节，瓜苗质量的好坏直接影响其植株的生长发育、产量和果实品质，培育优质健壮瓜苗对西瓜抗病、丰产和提高果实品质等具有重要作用。施用生物菌肥及有机肥可以促进植株生长和生物量的增加，提高产量和品质，改良土壤。生物有机肥由于其功能微生物的定殖可在根际形成优势菌群，从而抑制有害病菌的繁殖，同时向作物根际土壤微生态系统内分泌各种代谢产物，从而刺激作物生长。。生物有机肥是多种有益微生物菌群与有机肥结合形成的新型、高效、安全的微生物-有机复合肥料，综合了有机肥和复合微生物肥料的优点，具有增加土壤有机质和土壤有益微生物种群、促进作物生长、增加作物产量、提高农产品品质、改善土壤理化性状和增强农作物抗逆性等特点。

生物有机肥能提高西瓜果实中心糖含量，降低西瓜果皮厚度，但是效果不显著，而有研究表明生物有机肥可显著提高西瓜的可溶性糖含量。施用生物有机肥显著促进了保护地西瓜的生长，提高了西瓜的产量，并对西瓜品质有一定的改善作用，可在当地西瓜生产中推广施用。