活性腐植酸与微生物配施可以有效改善土壤状况，提高土壤酶活性，有利于作物的生长。腐植酸复合微生物肥还能够显著提高作物养分含量，有利于作物产量的提高。

微生物肥料之所以能迅速改善土壤理化性能、增强土壤肥力、提高作物产量和增强抗病能力，关键取决于土壤有益微生物种群数量的优势程度。微生物肥料对于改良土壤微生物区系、提高肥料利用率、提高作物产量和改善产品品质方面具有明显的作用。土壤生态系决定着土壤的肥力，适合土壤高效的微生物肥料在向土壤提供充分均衡养分的同时，向土壤中播入多种有益微生物，从而调整了土壤生态系的组成，促进了土壤团粒结构的形成，使土壤肥力不断提高。因此微生物肥料对可持续发展及实现生态农业会起到积极作用。

微生物菌剂能够诱导或激活有益微生物在植物根际或植物体内定殖的能力，抑制植物病原菌和根际有害微生物及促进植物生长，从而增加作物产量。微生物菌剂形成的菌根能够提高植物对根际矿质元素的吸收，改善植物的营养状况，促进作物生长。