长期施生物有机肥可以提高土壤脲酶的活性，其原因是无论是施用有机肥还是化肥都可以促进作物的生长，增加作物根系分泌物，加快微生物繁殖，相应地提高土壤脲酶活性。由于脲酶促进了植物可利用氮的释放，从而提高了作物的产量。机肥料提供的营养成分全面，可以改良土壤物理性状，增加土壤有机质，提高土壤的保水能力和土壤生物活性，改善作物品质；可以使农田稳产，肥力增加，维持土壤良好理化特性和生物群落，提供一个健康持续的土壤环境。

由于有机肥的施用土壤磷酸酶的活性显著提高，肥料施用量越大，土壤磷酸酶活性越高，其原因是施用有机肥促进作物根系的生长从而提高了土壤磷酸酶的活性。磷酸酶与土壤中磷的转化密切相关，提高了作物可利用磷的含量，因此可以提高作物产量。